Repository navigation
Expand file tree
/
Copy pathSVM.py
More file actions
342 lines (175 loc) · 8.44 KB
/
Copy pathSVM.py
File metadata and controls
342 lines (175 loc) · 8.44 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
'''
支持向量机,代码参考了《机器学习实战》
即寻找超平面:w*x+b=0,使得二分类有最大间隔
利用SMO算法,快速求解对偶问题,得到最优解w,b
作者:胡亦磊
'''
'''
在ε精度范围内违反KKT条件的点:
1、alpha[i]=0 ⇔ yiEi<-ε
2、0<alpha[i]<c ⇔ |yiEi|>ε
3、alpha[i]=c ⇔ yiEi>ε
alpha[i]=0或c时,称为边界点;0<alpha[i]<c,称为非边界点(nonbound)
'''
import numpy as np
import scipy.io as scio
from matplotlib import pyplot as plt
def loadDataSet():#载入数据集
dataFile='nonlinearData.mat'#读取mat数据集
data=scio.loadmat(dataFile)
dataset=data['nonlinear'].T#N*3的格式,N为样本个数,平面坐标X1,X2,标签Y
dataset=dataset[2300:2500,:]#选200个样本进行训练
positive=np.array([[0,0,0]])#+1的样本集
negative=np.array([[0,0,0]])#-1的样本集
for i in range(dataset.shape[0]):
if(dataset[i][2]==1):
positive=np.row_stack((positive,np.array([dataset[i]])))
else:
negative=np.row_stack((negative,np.array([dataset[i]])))
return positive[1:,:],negative[1:,:],dataset
'''
def kernel(xi,xj):#核函数(xi,xj为向量)
return xi.dot(xj.T)#内积(数据集线性可分或近似线性可分)
'''
sigma=10.0
def kernel(xi,xj):#高斯核函数(数据集线性不可分)
M=xi.shape[0]
K=np.zeros((M,1))
for l in range(M):
A=np.array([xi[l]])-xj
K[l]=[np.exp(-0.5*float(A.dot(A.T))/(sigma**2))]
return K
def findNonBound(alpha,C):#寻找非边界点
nonbound=[]
for i in range(len(alpha)):
if(0<alpha[i] and alpha[i]<C):
nonbound.append(i)
return nonbound
def selectJrand(i,N):#随机选择j
j=i
while(j==i):
j=int(np.random.uniform(0,N))#左闭右开,类型转化后0<=j<=N-1
return j
class SVM(object):
def __init__(self,X,Y,C,epsilon):
self.X=X#数据集N*D(D维特征)
self.Y=Y#标签(1,-1)
self.N=X.shape[0]#数据集大小
self.C=C#惩罚系数
self.epsilon=epsilon#精度
self.alpha=np.zeros((self.N,1))#拉格朗日乘子N*1
self.b=0#位移
self.E=np.zeros((self.N,2))#误差缓存表N*2,第一列为更新状态(0-未更新,1-已更新),第二列为缓存值
def computeEk(self,k):#计算缓存项Ek
xk=np.array([self.X[k]])
y=np.array([self.Y]).T
gxk=float(self.alpha.T.dot(y*kernel(self.X,xk)))+self.b
Ek=gxk-self.Y[k]
return Ek
def updateEk(self,k):#更新缓存项Ek包括计算Ek和设置对应的更新状态为1
Ek=self.computeEk(k)
self.E[k]=[1,Ek]
def selectJ(self,i,Ei):#内循环,根据i选择j
self.E[i]=[1,Ei]#更新Ei
validE=np.nonzero(self.E[:,0])[0]#validE保存更新状态为1的缓存项的行指标
if(len(validE)>1):
j=0
maxDelta=0
Ej=0
for k in validE:#寻找最大的|Ei-Ej|
if(k==i): continue
Ek=self.computeEk(k)
if(abs(Ei-Ek)>maxDelta):
j=k
maxDelta=abs(Ei-Ek)
Ej=Ek
else:#随机选择
j=selectJrand(i,self.N)
Ej=self.computeEk(j)
return j,Ej
def inner(self,i):
Ei=self.computeEk(i)
if((self.Y[i]*Ei>self.epsilon and float(self.alpha[i])>0) or\
(self.Y[i]*Ei<-self.epsilon and float(self.alpha[i])<self.C)):#alpha[i]违反了KKT条件
j,Ej=self.selectJ(i,Ei)#选择对应的alpha[j]
alphaiold=float(self.alpha[i])
alphajold=float(self.alpha[j])
if(self.Y[i]!=self.Y[j]):
L=max(0,alphajold-alphaiold)
H=min(self.C,self.C+alphajold-alphaiold)
else:
L=max(0,alphajold+alphaiold-self.C)
H=min(self.C,alphajold+alphaiold)
if(L==H): return 0
xi=np.array([self.X[i]])
xj=np.array([self.X[j]])
eta=float(kernel(xi,xi)+kernel(xj,xj)-2*kernel(xi,xj))
if(eta<=0): return 0
alphajnewunc=alphajold+self.Y[j]*(Ei-Ej)/eta#未剪辑的alphajnew
#更新alphaj
if(alphajnewunc>H): self.alpha[j]=[H]
elif(alphajnewunc<L): self.alpha[j]=[L]
else: self.alpha[j]=[alphajnewunc]
#更新Ej
self.updateEk(j)
if(abs(float(self.alpha[j])-alphajold)<0.00001): return 0
#更新alphai
self.alpha[i]=[alphaiold+Y[i]*Y[j]*(alphajold-float(self.alpha[j]))]
#更新Ei
self.updateEk(i)
#更新b
bi=-Ei-self.Y[i]*float(kernel(xi,xi))*(float(self.alpha[i])-alphaiold)-\
self.Y[j]*float(kernel(xj,xi))*(float(self.alpha[j])-alphajold)+self.b
bj=-Ej-self.Y[i]*float(kernel(xi,xj))*(float(self.alpha[i])-alphaiold)-\
self.Y[j]*float(kernel(xj,xj))*(float(self.alpha[j])-alphajold)+self.b
if(0<float(self.alpha[i]) and float(self.alpha[i])<self.C): self.b=bi
elif(0<float(self.alpha[j]) and float(self.alpha[j])<self.C): self.b=bj
else: self.b=0.5*(bi+bj)
return 1
else: return 0
def visualize(self,positive,negative):
plt.xlabel('X1')#横坐标
plt.ylabel('X2')#纵坐标
plt.scatter(positive[:,0],positive[:,1],c = 'r',marker = 'o')#+1样本红色标出
plt.scatter(negative[:,0],negative[:,1],c = 'g',marker = 'o')#-1样本绿色标出
nonZeroAlpha=self.alpha[np.nonzero(self.alpha)]#非零的alpha
supportVector=X[np.nonzero(self.alpha)[0]]#支持向量
y=np.array([self.Y]).T[np.nonzero(self.alpha)]#支持向量对应的标签
plt.scatter(supportVector[:,0],supportVector[:,1],s=100,c='y',alpha=0.5,marker='o')#标出支持向量
print("支持向量个数:",len(nonZeroAlpha))
X1=np.arange(-50.0,50.0,0.1)
X2=np.arange(-50.0,50.0,0.1)
x1,x2=np.meshgrid(X1,X2)
g=self.b
for i in range(len(nonZeroAlpha)):
#g+=nonZeroAlpha[i]*y[i]*(x1*supportVector[i][0]+x2*supportVector[i][1])
g+=nonZeroAlpha[i]*y[i]*np.exp(-0.5*((x1-supportVector[i][0])**2+(x2-supportVector[i][1])**2)/(sigma**2))
plt.contour(x1,x2,g,0,colors='b')#画出超平面
plt.title("sigma: %f" %sigma)
plt.show()
def SMO(X,Y,C,epsilon,maxIters):#SMO的主程序
SVMClassifier=SVM(X,Y,C,epsilon)
iters=0
iterEntire=True#由于alpha被初始化为零向量,所以先遍历整个样本集
while(iters<maxIters):#循环在整个样本集与非边界点集上切换,达到最大循环次数时退出
iters+=1
if(iterEntire):#循环遍历整个样本集
alphaPairChanges=0
for i in range(SVMClassifier.N):#外层循环
alphaPairChanges+=SVMClassifier.inner(i)
if(alphaPairChanges==0): break#整个样本集上无alpha对变化时退出循环
else: iterEntire=False#有alpha对变化时遍历非边界点集
else:#循环遍历非边界点集
alphaPairChanges=0
nonbound=findNonBound(SVMClassifier.alpha,SVMClassifier.C)#非边界点集
for i in nonbound:#外层循环
alphaPairChanges+=SVMClassifier.inner(i)
if(alphaPairChanges==0):
iterEntire=True#非边界点全满足KKT条件,则循环遍历整个样本集
return SVMClassifier
if __name__ == "__main__":
positive,negative,dataset=loadDataSet()#返回+1与-1的样本集,总训练集
X=dataset[:,0:2]#X1,X2
Y=dataset[:,2]#Y
SVMClassifier=SMO(X,Y,1,0.001,40)
SVMClassifier.visualize(positive,negative)