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<?php
/*
* OverHAL - Convertissez vos imports éditeurs en TEI - Convert your publisher imports to TEI
*
* Copyright (C) 2023 Olivier Troccaz (olivier.troccaz@cnrs.fr) and Laurent Jonchère (laurent.jonchere@univ-rennes.fr)
* Released under the terms and conditions of the GNU General Public License (https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.txt)
*
* Page d'accueil - Home page
*/
//authentification CAS ou autre ?
if (strpos($_SERVER['HTTP_HOST'], '127.0.0.1') !== false) {
include('./_connexion.php');
}else{
require_once('./CAS_connect.php');
$HAL_USER = phpCAS::getUser();
$HAL_QUOI = "OverHAL";
if($HAL_USER != "jonchere" && $HAL_USER != "otroccaz") {include('./Stats_listes_HALUR1.php');}
}
// récupération de l'adresse IP du client (on cherche d'abord à savoir s'il est derrière un proxy)
if(isset($_SERVER['HTTP_X_FORWARDED_FOR'])) {
$ip = $_SERVER['HTTP_X_FORWARDED_FOR'];
}elseif(isset($_SERVER['HTTP_CLIENT_IP'])) {
$ip = $_SERVER['HTTP_CLIENT_IP'];
}else {
$ip = $_SERVER['REMOTE_ADDR'];
}
?>
<!DOCTYPE html>
<html lang="fr">
<head>
<meta charset="utf-8" />
<title>OverHAL - HALUR</title>
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0">
<meta content="OverHAL permet de générer un fichier de publications TEI HAL pour Zip2HAL à partir d'un fichier source et de contacter les auteurs pour leur manuscrit" />
<meta content="Coderthemes + Lizuka + OTroccaz + LJonchere" name="author" />
<!-- App favicon -->
<link rel="shortcut icon" href="favicon.ico">
<!-- third party css -->
<!-- <link href="./assets/css/vendor/jquery-jvectormap-1.2.2.css" rel="stylesheet" type="text/css" /> -->
<!-- third party css end -->
<!-- App css -->
<link href="./assets/css/icons.min.css" rel="stylesheet" type="text/css" />
<link href="./assets/css/app-hal-ur1.min.css" rel="stylesheet" type="text/css" id="light-style" />
<!-- <link href="./assets/css/app-creative-dark.min.css" rel="stylesheet" type="text/css" id="dark-style" /> -->
<!-- third party js -->
<script src="OverHAL.js"></script>
<script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/Chart.js/2.5.0/Chart.min.js"></script>
<!-- third party js end -->
<!-- bundle -->
<script src="./assets/js/vendor.min.js"></script>
<script src="./assets/js/app.min.js"></script>
<!-- third party js -->
<!-- <script src="./assets/js/vendor/Chart.bundle.min.js"></script> -->
<!-- third party js ends -->
<script src="./assets/js/pages/hal-ur1.chartjs.js"></script>
<?php
//Stats Google
if (strpos($_SERVER['HTTP_HOST'], '127.0.0.1') === false) {
include("./Glob_gstats.php");
}
?>
</head>
<body class="loading" data-layout="topnav" >
<noscript>
<div class='text-primary' id='noscript'><strong>ATTENTION !!! JavaScript est désactivé ou non pris en charge par votre navigateur : cette procédure ne fonctionnera pas correctement.</strong><br>
<strong>Pour modifier cette option, voir <a target='_blank' rel='noopener noreferrer' href='http://www.libellules.ch/browser_javascript_activ.php'>ce lien</a>.</strong></div><br>
</noscript>
<!-- Begin page -->
<div class="wrapper">
<!-- ============================================================== -->
<!-- Start Page Content here -->
<!-- ============================================================== -->
<div class="content-page">
<div class="content">
<?php
include "./Glob_haut.php";
if(isset($_GET["erreur"]))
{
echo '<div id="warning-alert-modal" class="modal fade" tabindex="-1" role="dialog" aria-hidden="true">';
echo ' <div class="modal-dialog modal-md modal-center">';
echo ' <div class="modal-content">';
echo ' <div class="modal-body p-4">';
echo ' <div class="text-center">';
echo ' <i class="dripicons-warning h1 text-warning"></i>';
echo ' <h4 class="mt-2">Avertissement</h4>';
$erreur = $_GET["erreur"];
if($erreur == 1) {echo ' <p class="mt-3">Le fichier dépasse la limite autorisée par le serveur(fichier php.ini) !</p></script>';}
if($erreur == 2) {echo ' <p class="mt-3">Le fichier dépasse la limite autorisée dans le formulaire HTML !</p></script>';}
if($erreur == 3) {echo ' <p class="mt-3">L'envoi du fichier a été interrompu pendant le transfert !</p></script>';}
//if($erreur == 4) {echo ' <p class="mt-3">Aucun fichier envoyé ou bien il a une taille nulle !</p></script>';}
if($erreur == 5) {echo ' <p class="mt-3">Mauvaise extension de fichier !</p></script>';}
echo ' <button type="button" class="btn btn-warning my-2" data-dismiss="modal">Continuer</button>';
echo ' </div>';
echo ' </div>';
echo ' </div><!-- /.modal-content -->';
echo ' </div><!-- /.modal-dialog -->';
echo '</div><!-- /.modal -->';
}
?>
<!-- Start Content-->
<div class="container-fluid">
<!-- start page title -->
<div class="row">
<div class="col-12">
<div class="page-title-box">
<div class="page-title-right">
<nav aria-label="breadcrumb">
<ol class="breadcrumb bg-light-lighten p-2">
<li class="breadcrumb-item"><a href="index.php"><i class="uil-home-alt"></i> Accueil HALUR</a></li>
<li class="breadcrumb-item active" aria-current="page">Over<span class="font-weight-bold">HAL</span></li>
</ol>
</nav>
</div>
<h4 class="page-title">Convertissez vos imports éditeurs en TEI</h4>
</div>
</div>
</div>
<!-- end page title -->
<div class="row">
<div class="col-xl-8 col-lg-6 d-flex">
<!-- project card -->
<div class="card d-block w-100 shadow-lg">
<div class="card-body">
<!-- project title-->
<h2 class="h1 mt-0">
<i class="mdi mdi-widgets-outline text-primary"></i>
<span class="font-weight-light">Over</span><span class="text-primary">HAL</span>
</h2>
<h5 class="badge badge-primary badge-pill">Présentation</h5>
<img src="./img/ricardo-gomez-angel-horgenberg-horgen-switzerland-unsplash.jpg" alt="Accueil OverHAL" class="img-fluid"><br>
<p class="font-italic">Photo : Horgenberg, Horgen, Switzerland by Ricardo Gomez Angel on Unsplash (détail)</p>
<p class=" mb-2 text-justify">
OverHAL permet d'une part de générer un fichier de publications TEI HAL pour Zip2HAL à partir d'un fichier source, d'autre part d'envoyer des mails aux auteurs pour récupération du manuscrit auteur. Conçu à partir d'un script de <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/">Philippe Gambette</a> (CouvertureHAL), il a été créé par Olivier Troccaz (conception-développement) et Laurent Jonchère (conception). Son code est disponible <a target='_blank' rel='noopener noreferrer' href="https://github.com/OTroccaz/OverHAL">sur GitHub</a> sous licence <a target='_blank' rel='noopener noreferrer' href="https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.fr.html">GPLv3</a>.
</p>
<p class="mb-4">
Contacts : <a target='_blank' rel='noopener noreferrer' href="https://scienceouverte.univ-rennes.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere">Laurent Jonchère</a> (Université de Rennes) / <a target='_blank' rel='noopener noreferrer' href="https://scienceouverte.univ-rennes.fr/interlocuteurs/olivier-troccaz">Olivier Troccaz</a> (CNRS CReAAH/OSUR).
</p>
</div> <!-- end card-body-->
</div> <!-- end card-->
</div> <!-- end col -->
<div class="col-lg-6 col-xl-4 d-flex">
<div class="card shadow-lg w-100">
<div class="card-body">
<h5 class="badge badge-primary badge-pill">Mode d'emploi</h5>
<div class=" mb-2">
<ul class="list-group">
<li class="list-group-item">
<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="./OverHAL-Zip2HAL.pdf"><i class="mdi mdi-file-pdf-box-outline mr-1"></i> Importer des références par lots dans HAL</a><br>
</li>
<li class="list-group-item">
<a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="./Manuel-OverHAL.pdf"><i class="mdi mdi-file-pdf-box-outline mr-1"></i> Prise en main rapide</a><br>
</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
<!-- end card-->
</div>
</div>
<!-- end row -->
<div class="row">
<div class="col-12 d-flex">
<!-- project card -->
<div class="card w-100 d-block shadow-lg">
<div class="card-body">
<form enctype="multipart/form-data" action="OverHAL_results.php" method="post" accept-charset="UTF-8">
<input type="hidden" name="MAX_FILE_SIZE" value="3145728"><!-- 3 Mo max > 1024 * (1024 * 3)) > 3145728 octets -->
<h5 class="badge badge-primary badge-pill">Paramétrage</h5>
<div class="row mb-3">
<div class="col-sm-12">
<div class="border border-dark rounded p-2 mb-2">
<div class='h4 text-uppercase text-secondary mb-3'>Étape 1 : Charger le fichier (3 Mo max)</div>
<!-- <div class="border p-2 small text-primary mb-2">
Envoyez les fichiers résultat (900 Ko maximum, voir ci-dessus le "mode d'emploi") :
</div> -->
<div class="row">
<div class="form-group col-sm-4">
<label for="wos_csv" class="badge badge-secondary-lighten">Web of Science (CSV) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="wos_csv" name="wos_csv" type="file">
<label for="scopus" class="badge badge-secondary-lighten">Scopus (CSV) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="scopus" name="scopus" type="file">
<label for="pubmed_txt" class="badge badge-secondary-lighten">Pubmed (TXT) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="pubmed_txt" name="pubmed_txt" type="file">
<label for="wos_txt" class="badge badge-secondary-lighten">Web of Science (TXT) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="wos_txt" name="wos_txt" type="file">
</div>
<div class="form-group col-sm-4">
<label for="zotero" class="badge badge-secondary-lighten">Zotero (CSV) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="zotero" name="zotero" type="file">
<label for="scifin" class="badge badge-secondary-lighten">SciFinder (CSV) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="scifin" name="scifin" type="file">
<?php
include("./Glob_IP_list.php");
if (in_array($ip, $IP_aut)) {
echo '<label for="pubmed_fcgi" class="badge badge-secondary-lighten">Pubmed (FCGI) :</label>';
echo '<input class="form-control mb-1" id="pubmed_fcgi" name="pubmed_fcgi" type="file">';
echo '<span><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="OverHAL_FCGI_construct_import.php"> Construire un fichier FCGI à partir d\'une liste de PMID</a>, puis l\'envoyer à OverHAL avec le formulaire ci-dessus.</span>';
}
?>
</div>
<div class="form-group col-sm-4">
<label for="pubmed_csv" class="badge badge-secondary-lighten">Pubmed (CSV) : </label>
<input class="form-control mb-1" id="pubmed_csv" name="pubmed_csv" type="file">
<label for="pubmed_xml" class="badge badge-secondary-lighten">Pubmed (XML) : </label>
<input class="form-control mb-1" id="pubmed_xml" name="pubmed_xml" type="file">
<?php
//include("./Glob_IP_list.php");
//if (in_array($ip, $IP_aut)) {
echo '<label for="dimensions" class="badge badge-secondary-lighten">Dimensions (CSV) :</label>';
echo '<input class="form-control mb-1" id="dimensions" name="dimensions" type="file" />';
echo '<label for="openalex" class="badge badge-secondary-lighten">OpenAlex :</label>';
echo '<input class="form-control mb-1" id="openalex" name="openalex" type="file">';
echo '<span><a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="OverHAL_OpenAlex_construct_import.php"> Construire un fichier CSV à partir d\'une URL OpenAlex</a>, puis l\'envoyer à OverHAL avec le formulaire ci-dessus.</span>';
//}
?>
</div>
</div> <!-- .row -->
<div class="row border-top pt-3">
<div class="col-sm-12">
<div class="mb-2 small">
<span class="badge badge-primary badge-pill"><i class="mdi mdi-flash-alert mdi-18px"></i></span>
Expérimental (enregistrer des alertes mail en html) :</div>
</div>
</div> <!-- .row -->
<div class="row">
<div class="col-sm-3">
<label for="wos_csv" class="badge badge-secondary-lighten">Web of Science (HTML) :</label>
<input class="form-control mb-1" id="wos_html" name="wos_html" type="file">
</div>
<div class="col-sm-3">
<label for="wos_csv" class="badge badge-secondary-lighten">Pubmed (HTML) : </label>
<input class="form-control mb-1" id="pubmed_html" name="pubmed_html" type="file">
</div>
</div> <!-- .row -->
</div> <!-- .border -->
</div> <!-- .col-sm-12 -->
</div> <!-- .row -->
<div class="row mb-3">
<div class="col-sm-12">
<div class="border border-dark rounded p-2 mb-2">
<div class='h4 text-uppercase text-secondary mb-3'>Étape 2 : Construire la requête HAL</div>
<div class="form-group row mb-1">
<label for="reqHAL" class="col-12 col-md-2 col-form-label font-weight-bold">
Requête libre
</label>
<?php
$anneeencours = date('Y', time());
//$anneedeb = str_replace('+00:00', 'Z', date('c', mktime(0, 0, 0, 1, 1, $anneeencours)));
//$anneefin = str_replace('+00:00', 'Z', date('c', mktime(0, 0, 0, 12, 31, $anneeencours)));
$anneedeb = $anneeencours.'-01-01T00:00:00Z';
$anneefin = $anneeencours.'-12-31T23:59:59Z';
$periodeval = '['.$anneedeb.'%20TO%20'.$anneefin.']';
$reqHAL = "https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:\"IRSET\"&fq=(producedDate_tdate:".$periodeval."%20OR%20publicationDate_tdate:".$periodeval."%20OR%20inPress_bool:%22true%22)&rows=10000&fl=docType_s,docid,halId_s,authFullName_s,title_s,subTitle_s,journalTitle_s,volume_s,issue_s,page_s,producedDateY_i,proceedings_s,files_s,label_s,citationFull_s,bookTitle_s,doiId_s,conferenceStartDateY_i,publisherLink_s,seeAlso_s";
?>
<div class="col-12 col-md-10">
<div class="input-group">
<div class="input-group-prepend">
<button type="button" tabindex="0" class="btn btn-info" data-html="true" data-toggle="popover" data-trigger="focus" title="" data-content="consultez l'API de HAL <a href='https://api.archives-ouvertes.fr/docs/search'>https://api.archives-ouvertes.fr/docs/search</a>" data-original-title="">
<i class="mdi mdi-help text-white"></i>
</button>
</div>
<textarea id="reqHAL" name="hal" class="form-control" rows="5"><?php echo $reqHAL;?></textarea>
</div>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-1">
<div class="col-12">
<div class="custom-control custom-checkbox custom-control-inline">
<input type="checkbox" checked class="custom-control-input" name="limzot" id="limzot" value="ok">
<label class="custom-control-label" for="limzot">Limiter l'affichage des résultats aux seules références non trouvées dans HAL</label>
</div>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-1">
<div class="col-12">
<h3 class="d-inline-block border-bottom border-primary text-primary">OU</h3>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-3">
<label for="team" class="col-12 col-md-2 col-form-label font-weight-bold">
Code collection HAL
</label>
<div class="col-12 col-md-10">
<div class="input-group">
<div class="input-group-prepend">
<button type="button" tabindex="0" class="btn btn-info" data-html="true" data-toggle="popover" data-trigger="focus" title="" data-content='Code visible dans l'URL d'une collection.
Exemple : IPR-MOL est le code de la collection http://hal.archives-ouvertes.fr/ <span class="font-weight-bold">IPR-PMOL</span> de l'équipe Physique moléculaire de l'unité IPR UMR CNRS 6251' data-original-title="">
<i class="mdi mdi-help text-white"></i>
</button>
</div>
<input type="text" id="team" name="team" class="form-control" value="IRSET" onchange="majReqHAL();">
<a class="ml-2 small" target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://univ-rennes.hal.science/page/codes-collections">Trouver le code<br>de mon équipe / labo</a>
</div>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-1">
<div class="form-group col-sm-2">
<label for="year1">Période : Depuis</label>
<select id="year1" class="custom-select" name="year1" onchange="majReqHAL();">
<?php
$moisactuel = date('n', time());
if ($moisactuel >= 10) {$i = date('Y', time())+1;}else{$i = date('Y', time());}
while ($i >= date('Y', time()) - 30) {
if (isset($year1) && $year1 == $i) {$txt = "selected";}else{$txt = "";}
echo '<option value='.$i.' '.$txt.'>'.$i.'</option>' ;
$i--;
}
?>
</select>
</div>
<div class="form-group col-sm-2">
<label for="year2">Jusqu'à</label>
<select id="year2" class="custom-select" name="year2" onchange="majReqHAL();">
<?php
$moisactuel = date('n', time());
if ($moisactuel >= 10) {$i = date('Y', time())+1;}else{$i = date('Y', time());}
while ($i >= date('Y', time()) - 30) {
if (isset($year2) && $year2 == $i) {$txt = "selected";}else{$txt = "";}
echo '<option value='.$i.' '.$txt.'>'.$i.'</option>';
$i--;
}
?>
</select>
</div>
</div><!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-2">
<div class="col-12">
<div class="custom-control custom-checkbox">
<input type="checkbox" checked class="custom-control-input" name="aparai" id="aparai" value="ok" onchange="majReqHAL();">
<label class="custom-control-label" for="aparai">Inclure les articles "À paraître"</label>
</div>
<div class="custom-control custom-checkbox">
<input type="checkbox" class="custom-control-input" name="txtint" id="txtint" value="ok" onchange="majReqHAL();">
<label class="custom-control-label" for="txtint">Requête uniquement sur le texte intégral (dépôt HAL ou lien arxiv)</label>
</div>
<div class="custom-control custom-checkbox">
<input type="checkbox" checked class="custom-control-input" name="desactSR" value="oui" id="desactSR">
<label class="custom-control-label" for="desactSR">Désactiver les recherches Sherpa/RoMEO</label>
</div>
<?php
include("./Glob_IP_list.php");
if (in_array($ip, $IP_aut)) {
echo '<div class="custom-control custom-checkbox">';
echo ' <input type="checkbox" class="custom-control-input" name="actMailsM" value="oui" id="actMailsM">';
echo ' <label class="custom-control-label" for="actMailsM">Activer les procédures d\'envoi de mails (demande du manuscrit à l\'auteur = M)</label>';
echo '</div>';
echo '<div class="custom-control custom-checkbox">';
echo ' <input type="checkbox" class="custom-control-input" name="actMailsP" value="oui" id="actMailsP">';
echo ' <label class="custom-control-label" for="actMailsP">Activer les procédures d\'envoi de mails (autorisation de dépôt du post-print = P)</label>';
echo '</div>';
}else{
echo('<br/>La fonctionnalité d\'envoi d\'emails ne s\'affiche que pour les utilisateurs autorisés (adresse IP). Voir le mode d\'emploi / installation<br /><br />');
}
?>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-1">
<div class="col-12">
<div class="custom-control custom-checkbox">
<input type="checkbox" class="custom-control-input" name="bibtex" value="oui" id="bibtex">
<label class="custom-control-label" for="bibtex">Générer un bibtex de publications en français, à partir d'un fichier Zotero, avec éventuellement,</label>
</div>
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-2">
<label for="keywords" class="col-md-3 offset-md-1 col-form-label font-weight-bold p-0">
ces mots-clés <span class="small">(séparés par "; ")</span> :
</label>
<div class="col-12 col-md-6">
<input type="text" class="form-control" id="keywords" name="keywords" size="40">
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-2">
<label for="author" class="col-md-3 offset-md-1 col-form-label font-weight-bold p-0">
cet auteur <span class="small">("Mortier, Renaud", par exemple)</span> :
</label>
<div class="col-12 col-md-6">
<input type="text" class="form-control" id="author" name="author" size="40">
</div>
</div> <!-- .form-group -->
<div class="form-group row mb-1">
<label for="joker" class="col-md-2 col-form-label font-weight-bold">
URL Joker :
</label>
<div class="col-12 col-md-10">
<input type="text" class="form-control" id="joker" name="joker" size="40">
</div>
</div> <!-- .form-group -->
</div> <!-- .border -->
<div class="form-group row mt-4">
<div class="col-12 justify-content-center d-flex">
<input type="hidden" name="ip" value="<?php echo $ip; ?>">
<input type="submit" class="btn btn-md btn-primary btn-lg" value="Valider" name="soumis">
</div>
</div>
</div> <!-- .col-sm-12 -->
</div> <!-- .row -->
</form>
</div> <!-- end card-body-->
</div> <!-- end card-->
</div> <!-- end col -->
</div>
<!-- end row -->
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<!-- content -->
<?php
include('./Glob_bas.php');
?>
</div>
<!-- ============================================================== -->
<!-- End Page content -->
<!-- ============================================================== -->
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<button id="scrollBackToTop" class="btn btn-primary"><i class="mdi mdi-24px text-white mdi-chevron-double-up"></i></button>
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var y = $(this).scrollTop();
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$(this).click(function(){
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