请问 positive/negative strand information 是啥意思呢

[nolanjj]

是比对到正链还是负链吗，
如果是链特异性建库，read1 read2 的方向是不是不一样，为什么他们会与顶部的ref seq 序列一样 呢
求解答，万分感谢，困扰了好几天了

[TuBieJun]

是比对到正链还是负链吗， 如果是链特异性建库，read1 read2 的方向是不是不一样，为什么他们会与顶部的ref seq 序列一样 呢 求解答，万分感谢，困扰了好几天了

对， 是正负链的意思。
read1和read2的原始序列的方向是不一样的，但bam文件以及后续各类软件为了方便都会先把比对到负链的reads序列先反向互补后再做后续的分析, 也就是统一处理为和ref seq同向的序列。

[nolanjj]

是比对到正链还是负链吗， 如果是链特异性建库，read1 read2 的方向是不是不一样，为什么他们会与顶部的ref seq 序列一样 呢 求解答，万分感谢，困扰了好几天了

对， 是正负链的意思。 read1和read2的原始序列的方向是不一样的，但bam文件以及后续各类软件为了方便都会先把比对到负链的reads序列先反向互补后再做后续的分析, 也就是统一处理为和ref seq同向的序列。

好的！感谢感谢！！！