diff --git a/README.md b/README.md index 1e70fa0..ed7ac14 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -138,3 +138,21 @@ The 40 newly added transposable element (TE) sequences are highly accurate conse This rigorous combination of computational searching and manual inspection confirmed the presence and structural integrity of the TSDs across the sequences, ensuring that the consensus boundaries are well-understood. * **Novel Lineage Isolation:** The `RIL_YJ_0#LINE/L1` entry is a newly built de novo consensus. Due to its low sequence similarity to existing LINE/L1 elements in `maizeTE02052020`, it has been established as a novel consensus family. + +06/02/2026 + +Strand orientation was assigned to all 1,517 consensus sequences and the previous library maizeTE04092026 was moved to history/. Strand calls are encoded as tab-separated metadata in each FASTA header (e.g., `>CRM1_6867nt#LTR/CRM\tstrand=+; evidence=TEsorter`). Of the 1,517 sequences, 762 (50%) received a strand assignment (643 `+`, 119 `-`); 755 remain `strand=?` where evidence was insufficient. All sequences are reported on the (+) strand: the 119 originally assigned `strand=-` were reverse complemented and their headers updated to `strand=+`. + +**Stranding Pipeline:** + +Strand orientation was determined using a four-tier evidence hierarchy applied to the full B73 TE consensus library (11,483 sequences), from which the 1,517 MTEC sequences are a subset. + +* **E1 — TEsorter (primary):** Protein domain orientation was inferred from [TEsorter](https://github.com/zhangrengang/TEsorter) output. RT and integrase domain alignments were used to determine the coding strand for LTR retrotransposons; TIR transposase domains for DNA transposons. E1 provided strand calls for 1,030 elements across the full library and was treated as the highest-confidence evidence tier. + +* **E2 — HMM domain scanning (HMMER):** For elements left unresolved by E1, 6-frame translation was searched against TEsorter-bundled HMM databases. No elements received an E2-only call in this library. + +* **E3 — IsoClassifier (long-read isoform data):** Strand was inferred from B73 long-read isoform alignments classified with [IsoClassifier](https://github.com/cgooden-TE/LTRRT-Promoter-Suite/tree/main). TE consensus copies were mapped to isoform-supported gene models; the majority strand of mapped copies was assigned to the consensus. E3 provided calls for 51 elements, 43 of which were concordant with E1. Four cinful_zeon (LTR/Gypsy) elements showed E1/E3 conflict; E1 was retained in all four cases. + +* **E4 — LTR cluster propagation:** Strand calls were propagated within clusters of related LTR-RT sequences identified from the B73 TE annotation GFF3. Copies sharing high sequence identity were grouped; if a cluster contained a stranded member, that call was extended to unstranded relatives. E4 resolved 3 additional elements. + +Where multiple evidence tiers agreed, the call was assigned high confidence. E1 was authoritative in all conflicts. diff --git a/maizeTE04092026 b/history/maizeTE04092026 similarity index 100% rename from maizeTE04092026 rename to history/maizeTE04092026 diff --git a/history/maizeTE06022026 b/history/maizeTE06022026 new file mode 100644 index 0000000..2bd76eb --- /dev/null +++ b/history/maizeTE06022026 @@ -0,0 +1,97423 @@ +>CRM1_6867nt#LTR/CRM strand=+; evidence=TEsorter +TGATGAGGACATCAACACCAACACGAGTACATCTACACCAGCAGCACCTTCTCCAGCCCA +GGCACCATCTTC CCCAGTCCAGGCACCACCCCTTCCACTTGGGCCAGTGACTCGGGCCC +GTGCAAGAGAATTGAACTACATCAT GCTGTTAAAGAACAAAGGCCCAGAAGATTAGAAG +ATGGCCCAACAGGAAGGCCCGGATGGGGCGCCTAGGGA AGTCGTGAACAGTAACCGCGG +TACTGTAGCACCGGCTCTACTGTTCACGCCTCTCCTCTATTTAGTCAGAGT CATGTTTC +ATTTAGAACTTGAGTTTTGTTTTACATCTAGCTTTAGCTACCCCAGAACACGCACAAATA +CGTG TTGTCCTCTGTGATTCAGAACTCCACCTCGAGTGATATTAAGATTGCTCGCATCT +TTTTCTTGTTCGTTCTT CGATTGCGCACAGGAAACGATCTTCGTGATCAGGCCGATCTC +GCATTAGCAAGGTTGGTAACCATTGGGAGT TGGTTCAGCGATTGCATTGGCGCTTCGGG +TTCGCTCGTCATAGTCGGATCGTGAGGGTCTACTTCCACCAAA TCGGAATTATCTCCAC +TCACCGAAAGATTGGGCACTCCAGCTCTATCAAGTGGTATCAGATTTCCAGGTTGA TCG +GTGAGTTTATCGAGTGTTTTTTTCTCCTATAGTCCACAAAACCACATAAAAATTTAGGTT +AGACCTTAT CCCAGCACCCTTTTGAGCCTCACACTTTCTTTCAATAATCTGCATTGTTG +AATTTGTGTGCTTTCACGTCAT TTGTTGCTGGTTGCGTTGTGTTATTCCACCGTTCAAA +CCCTAGCGCGCCGCCACCATATTCCGTTTGATCAC ACCACAAACCGAGTCAACGCCGCT +TCCTTATTTTTCTCCTTCGGTTACGTAAAAAACAGAAAAAAAACAAAC CGAGTCAACGC +CGCTTCCTTGTTTTTCTCCTTCGGTTACGTAAAAAAAACAGAAACAAAAAAAAAGAAAAC +G AAGGAGAAAGGATACAAAGCGATTGTCTCATCTCGGTCGTTTTAAACATACCTTCCTT +AAACCGGGCATAAC TTTTCGCTCGATTGTTCAAAAATCTGAAATTTTTACAGGAGCTTG +TTGACACCATTCTGAGGCCGGCCAAAC TGGCCTACGACCTGTTTGGTTTCGATAAAATT +GTCAAAACAATTCAGGAAAATTGTCAAAAAAATTCGTCAA AGTTCTCGCACGCTTTTCA +GAGAACTTCCTGATTTTCTGTAGACCACATCTGAACTCTGTTTTAGATGAAAC TTCGTG +TAGCTCCTGTTTTGTTGTTCCTTGTGCTGAGAAAAATATCAAAAAAATCATACAAAAAAG +AAAAAC AAAATCACCTGTGATTCCTACTAGTGCCTTTTTGGCCTCGCTAGTACAATATT +TACGGTACTGCCATTTTGC TAGTTCCATCCGTCCTTTGTACTTGTGGCCCAGCAATATA +GTTTTGTGTTTTGCACTATACTTCAACTTTGC ATTATTGTTTGATCGTGCTAATCCTTG +ACTTGAGTGCAGCCTACCCAAAACTCCACATATTTCTATGACGAG AAGGTTTCTGTTTC +TCCAGGCAATCGCTCATCCAATCTTGCACCGGTTCCACCTGTTGGTTGCAGTTCACCA C +TATGGCTTAGTAAGAACGGATAAGAACTTGATAACAGCATTCCATTGAGCGAGTTGTCAC +CACCATTTCCC TGTTGTCGTCGGTTTTTCTCCTTTTGGTGTTTTGGTGTTTGCGCTAAC +TATGGCAGGAGCACACGACACGGT GGATGCCCAGTTGCTGGAAGTAAGGGGACAAGTTG +ATGGACTTGCTGCTGACATTAGGTCAATGCATGAATG GCTTGATTCAATGGTCACTTCG +ACGACCGAGCGTTTCAACCAGCTTGACCTTGCTCAAACGGCGACTCGCAC CACACTCGA +CACCATCCTGGCACGCGTTGATGTGTTGACCACAAAGATGGAGCAGGACTACGGCGGTGA +CAC TGAGCAGGACGATGGAGATCGCCGTGGTCGTGCACGCCGTGTGGTTCGTCATCCCC +CTAATGACTTATTTTC TAAGATTAAATTTAAAATTCCACCTTTTAATGGCAAATATGAT +CCTGCTGCATATCTTGATTGGGAGTTAGA GGTTGAACAAAAATTTTCATGCCATGATAT +TGTTGCACATTCTCAGGTTAAAGCTGCTATTAGTGAATTTAC TGATTTTGCTTTAATTT +GGTGGCATGAGTATAAAATAAAACATCCCACTGCCATTTCAACCACTTGGGATCA GTTG +AAAGCTGCGATGCGACATCGAATTGAGCCTTCGTATTATTCTCGTGATTTGCTTAATAAA +ATGCAGCG TTTTCAGCAAGGTTCTCAATCTGTTGAGGACTATTTCCAGGAGTTACAAAA +AGGTATGATTCGTTGTGGGAT ATTGGAAGACAACGACACTGCTATGTCACATTTTCGTG +GTGGTTTAAACCGTGAAATCCAGGATATACTTGA TTATAAGGAATATTATGATATGACT +ACTTTATTTGAATATGCTTGCAAAGCTGAACGTGAAGTGCAGGGACG CCGCTCGAAGCC +ATATTCTAACCCTTTTGCAGGACGAAGCTCGACATCCACCTCAGCACAAGTTCCCCCTGC + GCCATCCACGTCCACCACTACTCCATGCGAGAAGACGACCAAACTAGCCAGCACTGCCC +CACCCACAGGTCG TACACGGGATATTCAGTGTCATCGCTGTAGAGGATTTGGCCATGTG +ATTCGGGACTGCCCAAACAAGCGCAC TTTGCTCATTCGTGACGATGATGAGTACTCTTC +CGCTAGTGATTCTGAAGAAATTGAACATGCACTACTTGC CACTGACCATGCAGCTCAGG +CGGAGGTACATGTCAACCCGAGCGACGCTGATAGGTATGAAAGTCTTGTTGT GCAGCGT +GTTCTTAGTACACAGGACGCTTTGCCCGAGAAGAATCAGCGACACACTCTGTTCCATACA +AAGGG TGTTGTGCAGGAGCGGTCAATTCGCATCATTATCAACAGCGGCAGTTGTAACAA +TTTGGCGAGTACCATGCT GGTTGAAAAGTTGTCGTTACCCACTCGTAAGCATCCAAACC +CATATCATATTCAATGGCTTAATGATGGTGG TAAAATAAAATTTACACATTCCGTGCGT +GTTCCTTTCTCCATGGGTCCTTATTCTGATTTTGTTGATTGTGA TGTTATTCCCATGAA +AGCATGCACTTTGTTACTTGGTCGACCTTGGCAATATGATACTGATAGCTTGCATCA TG +GTCGTTCGAATCATTATTCTCTCATTTTTAAGGGTCAGAAAATAATTATACATCCAATGA +CACCTGAACA AATTGTTAAAGATGATCTTGCCCGAGCTGCTATAACTGCTAAACAACTT +GATCCATCGCCCTCTATTCCTTC TGAAATCAAGTTGAAGGCTCCTGTTTTACTTGCTAC +ACGTGCTGATTTTGATGATCTACACGGTGCTCATTT GCCATGCTATGCACTTGTATGCT +CTAGTGTCCTCATTTCACTTGATGATGCACCATCTTTGGCTATTCCCCC TGTGGTTGCT +AACCTTTTGCAGGAGTACGCTGATGTCTTTCCCAAAGACTTACCACCGGGTCTCCCACCG +CT TCGTGGCATTGAGCACCAGATCGACCTCATCCCCGGCGCACAGCTTCCGAACCGCGC +ACCGTACCGTACAAA TCCGGATGAGACGAAGGAGATTCAGCGCCAGGTACAGGCGTTGC +TTGACAAGGGATACATTCGTGAGTCTCT TAGCCCTTGCTCTGTTCCTGTGTTACTTGTT +CCCAAGAAAGATGGGTCATGGCGTATGTGTGTAGATTGTCG TGCTATTAATAACATCAC +TATTCGTTATCGATATCCTATACCACGCATTGATGATATGCTAGATGAGATTAG TGGTG +CCATTATTTTCACTAAGATTGATTTGCATAGTGGTTACCACCAGATTAGAATGAAACTGG +GTGATGA ATGGAAAACGGCTTTTAAAACGAAATTTGGTTTATATGAATGGTTGGTTATG +CCGTTTGGATTGACTAATGC TCCCAGCACTTTTATGCGAGTGATGAATGAAGTTCTGAG +GCCCTTCATAGGATTGTTTGTGGTTGTTTATTT TGATGATATCCTTATTTACAGCAAAT +CTAAGAAAGAGCATTTGGAACATTTAAGTGTTGTTTTTGATGCATT GTGTGCTGCCCAG +TTATTTGCTAACATGGAAAAATGCATCTTTTGCATACGACGTGTCTCGTTTCTTGGTTAT +GTTGTTACTCCACAGGGCATTGAGGTGGATAGCAGCAAGATTGCTGCCATTCGGGAGTGG +CCTACACCGAC GACGGTCACACAAATTCGGAGCTTTCTTGGATTTGCCGGTTTCTACCG +CAGATTTATTCGTGATTTTAGCTC CATTGCAGCGCCTCTACATGAGCTTACAAAGAAAG +ATGTGCCATTTGCTTGGAGTGATTCGCAGGAGGTAGC GTTCAGCACTTTGAAAGATAAG +TTAACCCAAGCTCCCCTATTGTAATTGCCTGATTTTAATAAAGTGTTTGA GCTTGAATG +CGATGCTAGCGGTATTGGGCTAGGTGCTGTTTTGTTACAAGAAGGAAAACCAGTTGCTTA +TTT TAGTGAAAAATTAAGCGGTGCTAGTCTAAAATATTCTACTTATGATAAGGAGCTTT +ACGCTTTAGTGCGCAC TTTGCATACATGGCAGCACTATCTTTGGCATCGTGAGTTCATA +ATTCATTCTGATCATGAGGCTTTAAAACA TATTCATACCCAAACAAATCTGAACCGTCG +TCATGCTAAATGGGTAGAATTCATTGAGTCTTTTCCTTACAT TATTAAACACAAGAACG +GGAAGGACAATGTTATTGCTGATGCTTTGTCTCGTCGCTATACCATGTTGTCACA GTTA +GATTTTAAAATCTTTGGTTTGCACACTGTGAAAGATCAATATGTTGACGATGCTGATTTT +AAAGATGC TTTCGGCCATTGTATTAATGGGAAACCATAGGGCAAATTTCACATACAGGA +TGGGTTCCTGTTTCGCGCTAA CAAGCTGTGTGTTCCAGCTAGCTCGGTTCGTCTTTTGT +TGTTACAGGAAGCGCATGGAGGCGGTCTCATGGG GCACTTTGGCGTCTACAAGACACAT +GAGGTGTTGGTTGCCCACTTCTTTTGGCCTCGGATGCGCGCTGATGT TGAGCGCCTTGT +TGCATGCTGCACTACTTGTCAGAAAGCTAAGTCACGGTTGAACAACCATGGTTTGCATAT + GCCTTTGCCTGTTCCTACTTCCCCTTGGATTGATATTTCGATGGATTTTGTTTTGGGAT +TGCCTAGAACTAA GAAGGGGAGGGATAGCATTTTTGTGGTTGTTGATCGATTCTCCAAA +ATGGCTCATTTCATACCTTGTCATAA GACTGATGATGCTAGCAATGTTGCTGAATTGTT +TTTTAGAGAGATTATTCGTTTGCACGGTATTCCCAATAC AATAGTCTCGGATCGTGATG +CTAAGTTTCTCAGTCATTTTTGGAGATCTCTGTGGAATAAATTGGGAACTAA ATTGCTG +TTTAGCACCACCTGTCACCCTCAGACTGATGGTCAAACTGAGGTAGTTAATCGAACTTCG +TCTAC CATGCTTAGGGTTGTTTTAGGCAAAAATTTGAAACGTTGGGAGGATTGCTTGCC +TCATGTTGAGTTTGCTTA TAATCATGCAACACATTCTTCTACAAAGATGTGCCCTTTTC +AAATTGTTTATGGTTACATTCCTAGGGCGCA TATTGCTTTGTTTTCGCTTGATGCTGCG +GACACCCCACACATAGATGTTGTTGCACATGTTGAACAAATGAT TAACCTCCATGAACA +AACTCAACAAAACATTGCTGCTGCTAATGCTAAATATCATATTACTGGTAGTAAAGGCCA +GAAACTAGTTACTTTTGAACCTGGTGATATGGTTTGGTTGCATTTGAGAAAGGATCGTTT +TCCTACTTTGCGTCGTTCTAAATTGAAGCCTCGTGCTGCTGGTCCTTTTAAGATACTAAC +CAAGATTAATGCTAATGCTTATATCCTTGATCTGCCTTCGGAATTTGGTGTTTCCACTAG +TTTTAATGTTGCGGATTTGAAACCGTATGCGGGAGAAGATGAGGAGTTGCCGTCGAGGAC +GACTTTAGTTCAAGAAGGGGAGGATGAGGAGGACATCAACACCAACACGAGTACATCTAC +ACCAGCAGCACCTTCTCTAGCCCAGGCACCATCTTCCCCAGTCCAGGCACCACCCCTTCC +ACCTGGGCCAGTGACTCGGGCCCGTGCAAGAGAATTGAACTACATCATGCTGTTAAAGAA +CGAAGGTCCAGAAGATTAGAAGATGGCCCAACAGGAAGGCCCGGATGGGGCACCTAGGGA +AGTCGTGAACAGTAACCGCGGTACTGTAGCGCCGGCCCTACTATTCATGCCTCTCCTCTA +TTTAGTCAGAGTCCTGTTTCATTTAGAACTTGAGTTTTGTTTTACATCTAGCTTTAGCTA +CCCCAGAACACGCACAAATACGTGATGTCCTCTGTGATTCAGAACTCCACCTCGAGTGAT +ATTAAGATTGCTCGCTTCTTTTCCTTGTTCGTTCTTCGATTGCGCACAGAAAATGATCTT +CGTGATCAGGCCGATCTCGCATCAGCAAGGTCGGTAACCATTGGGAGTTGGTTCAGCGAT +TGCATTGGCGCTTCGGGTTTGCTCGTCGTAGTCGGATCGTGAGGGTCTACTTCCACCAAA +TCGGAATTATCTCCACTCACCGAAAGATCGGGCACTCCAGCTCTATCA +>CRM2_7577nt#LTR/CRM strand=+; evidence=TEsorter +TGATGAAGACGTCCACACTACTGATACATCTATGCCAATACAAGTACCAATTTCTGGTCC +CATTACTCGCGC TCGTGCTCGTCAACTCAACCATCAGGTGATTACACTCTTGAGTTCAT +GTCCATCTTATTTAGACCATGGAGA CCCGTGCACTCTTGTTTTGCTTAGGAACCAGGGA +GAAGACCGAAAGGGAAAAGGATTTGAACATGCTGGATT CGGACTGCAGAAGAACACCAA +CTTGTGACGGTCACCACGGTCAGATGCGGGCTCGGATTGGAATGTTCAAGC ACAACATG +GAAAGCTTATCAAGTCTACTTTCATATGGATCCGGAATTATAGTCATATCTATTCTGAGG +CCGC CGTAATCATTGTTTTCTTACCGAGATATTTTCTGCCTTTTTCTGCCCATGGTGCT +GCGTCACCCTATTTTGG CCCAATGGGTCGTGTATCAAGTTAGGTCCATTAGGGACGCAT +CCTAGGGTTGCAGCACGACCCCAATACCCT TGTGGTCGTCCTCCCATGTTTATAGACCC +CCTAGCCGCCACCAAGAACAGGGGGTTTTGTTTAGATCAAGTT TAGCTCTCGCTACTTG +CTTGTAAGCGCGCGTGCTAGTTCAGCCGCCCGTCTTCTTGTCTTCGGAACCCCACC ATA +TTGGAGTTTGATTTTGAAACCTACATTTAGATCTGGTAATTCAGTACTTGTTCTACTTGT +TCTTGCTAG TTCTTCGATTGCTTGCAGGACGAGTGCCCTAGTGGCCAGGGTGTCACGCT +CCACAAGATCGTGACAACCATA GGAGGTGGTGTATCGGTTGCTAAGGCGCAGCGTCTTT +GGAAGGCTGTAGTCGGGCCGTGAACGTCGTCTCCT TCCCCAATCGAGTTATTCCACACC +CTCTCATCGAAAGATCGGGCAATCACCGAACGGGTGCACATCAGTTGG TATCAGAACAA +GGTTTATCGGTGAGAGATTTACTTTTCTTCGCTGTTTTCTTATCTCCTATAGTCCAGAAA +A AGCCAAAAATAGTAGATTAGTTTTACCGCAATCCTATAAACCATTGAGCATTTACTAG +TACTACTTAGTTAG GGCTTGTTGAGTTTTTGGTTGCATCGGTTGTGTCGAGTTGCTGGT +CTTAGTTTATTCCTTTAGAGTTTTGAG TTCTACCACGTTTTGGTCACCACGAGATCCAC +CATCACCAAAAACATCTCTGGTTCGTTTTTGCCACCACGG ATACATATCATATCCGATT +TGGAAGTTTAAATACAATCTGGAAAGCTTATCTTATCTTCTTTCCAACGGATC TGACCT +TATCTCAAAATTCGTTCTGAGCGCTCCGCAATCATCGTAGAGATTTCTGGACTTTCTATA +TTAACA AGATTTGTTAAATCTGATTTAAAGGGGCTGTTAGCAATATCTTTATTGTTTGG +GTTGTCATAGTGAAAAAAA AGGGTTTAGGTCCCTGCAAAAAAAAAACAGAAGAAGAAGA +AAAAAAAAGAATAGAAAAGAAAAAAAAAGGAA AAGAAGAAGAAGGGGGCTGAATCTCTA +AATCTGTTGTTTCTCTTTGTGCTGTGCTAGTTGTTCTTTTTCAGT GACTACCTTTGTGC +CTAGGCTCACGTCTCTAGCCTGGTTTAGCCTAGGACCAGCACAGTACCACCGTTGAAC G +ATTATTCAGCTTGCTTTTGTAACTAACGTGGTACTAGTGTATTCCTTGCTTCAGCCCACC +TACAACTCTAC ATATTTCGACTACAGTTTGACAGGTCGTGTTGCTGCGGCACCGATACA +CTTATTCCACGGTTGCAGACTTGT TGGTTGCTGACCCCTCCTGTTGTGCAAGGTAAGAA +TTGGTAAGAGCTTGTGTGGCAGGTTGAGAGTGAGCGC CTTGCAGTAGCTACATCCTAAT +AGTTGTAGAGTTTTTATTCCTTCACGTTTTTTTTTCTTGTTGCCTCTGTT CGTCTAACC +ATGGCAGGATTGGAGGTTGATGATGCTTCTCGTAATATGCCACACTCTCCTCGCACCAAG +GGT ATCATACAACACTTTGTAAGGCTGGTGAAGACGCACACGGAAGGTCTTGATAATGA +CATGCAGGTGACGAAT GAAAAGATGGGGCAATTGGAGGCCACACAGATCGACACAAACA +CCAAACTTGCAAATGTGGAAATGACAGTT GCTCATATTGACAAGAGCCTTGTCGCACTC +TTGAGGCGGTTTGATGAGATGCATGCTAATATCAATGGTGGG CGTGATGAGGGCGCCGA +AGGTAACTGGGATGACTATGTTGCTGATACTGAACAAGATGACCAAGAAGCACCT AATC +GCCGGCGACTACGTACTAACCGTAGAGGTATGGGTGGTTTTCGCCGACGTGAAGGTACAT +GGTAATGA TGATGCTTTTAGTAAGGTTAAATTTAAAATACCTCCTTTTGATGGTAAATA +TGACCCTGATGCTTACATTAC TTGGGAGATTGCGGTTGATCAAAAGTTTGCATGCCATG +AATTTCCTGAGAATGCGCGGGTTAGAGCTGCTAC TAGTGAGTTTACTGAATTTGCTTCT +GTTTGGTGGATAGAACATGGTAAGAAGAATCCTAATAACATGCCACA AACTTGGGATGC +GTTGAAACGGGTCATGCGGGCTAGATTTGTTCCTTCTTATTATGCACGTGATATGTTAAA + CAAGTTGCAACAATTGAGACAGGGTACTAAAAGTGTAGAAGAATATTATCAGGAATTAC +AAATGGGTATGCT GCGTTGTAACATAGAGGAGGGTGAGGAATCTGCTATGGCTAGATTT +TTGGGCGGGTTAAATAGGGAAATTCA GGACATCCTTGCTTATAAAGATTATGCTAATGT +AACCCGATTGTTTCATCTTGCTTGCAAAGCTGAAAGGGA AGTGCAGGGACGACGTGCTA +GTGCAAGGTCTAATGTTTCTGCAGGAAAATCTACACCATGGCAACAGCGCAC GACTACG +TCCATGACCGGCCGTACACCAGCACCAACTCCTTCGCCAAGTCGACCAGCACCCCCGCCT +TCCTC CAGCGACAAACCACGTGCATCTTCCACAAATTCAGCAACCAAATCTGCCCAGAA +ACCCGCAGGTTGTGCCTC TTCAGTAGCTTCCACAGGTAGAACAAGAGATGTTCTGTGTT +ATCGATGCAAGGGCTATGGACACGTGCAGCG TGATTGTCCTAATCAGCGTGTTTGGTGG +TAAAAGACGATGGTGGGTATTTCCTCTGCTAGTGATTTGGATGA AGCTACACTTGCTTT +TGCTTGCGGCTGATGATGTAGGCTATAAGGAACCACCTGAAGAACAGATTGGTGCAG AT +GATGCAGAGCATTATGAGAGCCTCATTGTACAGCGTGTGCTTAGTGCACAAATGAAGAAG +GCAGAGCAGA ATCAGCGACATACGTTGTTTCAAACAAAAGTGTGTCATTAAGGAGCGTT +CATGTCGTTTGATCATTGATGGA GGTAGTTGCAAACAACTTGGCTAGCAGCGACATGGT +GGAGAAGCTTGCACTTACGACCAAACCGCACCCACA TCCATATCACATTCAATGGCTCA +ACAATAGTGGTAAGGTCAAGGTAACCAAGCTGGTACGAAATTAATTTTG CTATTGGTTC +ATATCGTGATGTTGTTGACTGTGATGTTGTGCCTATGGATGCTTGTAATATTCTGCTAGG +TA GACCATGGCAATTTGATTCAGATTGTATGCATCATGGTAGATCAAATCAATATTCTC +TCATACACCATGATA AGAAAATTATTTTGCTTCCCATGTCCCCTGAGGCTATTGTGCGT +GATGATGTTGCTAAAGCTACCAAAGCTA AAACTGAGAACAACAAGAATATTAAAGCTGT +TGGTAATAACAAAGATGGGATAAAATTGAAAGGACATTGCT TGCTTGCAACAAAAACTG +ATGTTAATGAATTATTTGCTTCCACTACTGTTGCCTATGCCTTGGTATGCAAGG ATGCT +TTGATTTCAATTCAAGATATGCAGCATTCTTTGCCTCCTGTTATTACTAACATTTTGCAG +GAGTATT CTGATGTATTTCCAAGTGAGATACCAGAGGGGCTGCCACCTATACGAGGGAT +TGAGCACCAAATTGATCTTA TTCCTGGTGCATCTTTGCCGAATCGTGCGCCATATAGGA +CAAATCCAGAGGAAACAAAAGAAATTCAGCGAC AAGTGCAAGAACTACTCGACAAAGGT +TACGTGCGTGAGTCTCTTAGTCCGTGTGCTGTTCCGGTTATTTTAG TGCCTAAAAAAGA +TGGAACATGGCGTATGTGTGTTGATTGTAGGGCTATTAATAATATCACGATACGTTATCG +ACACCCTATTCCACGTTTAGATGATATGCTTGATGAATTGAGTGGTGCCATTGTCTTTTC +TAAAGTTGATT TGCGTAGTGGGTACCACCAGATTCGTATGAAATTGGGAGATGAATGGA +AAACTGCTTTCAAAACTAAGTTCG GATTGTATGAGTGGTTAGTCATGCCTTTTGGGTTA +ACTAATGCACCTAGCACTTTCATGAGATTAATGAACG AGGTTTTGCGTGCCTTCATTGG +AAAATTTGTGGTAGTATACTTTGATGACATATTGATCTACAGCAAATCTA TGGATGAAC +ATGTTGATCACATGCGTGCTGTTTTTAATGCTTTACGAGATGCACGTTTATTTGGTAACC +TTG AGAAGTGCACATTTTGCACCGATCGAGTTTCGTTTCTTGGTTATGTTGTGACTCCA +CAGGGAATTGAGGTTG ATCAAGCCAAGGTAGAAGCGATACATGGATGGCCTATGCCAAA +GACTATCACACAGGTGCGGAGTTTCCTAG GACTTGCTGGCTTCTATCGCCGTTTTGTGA +AGGACTTTAGCACCATTGCTGCACCTTTGAATGAGCTTACGA AGAAGGGAGTGCATTTT +AGTTGGGGCAAAGTACAAGAGCACGCTTTCAACGTGCTGAAAGATAAGTTGACAC ATGC +ACCTCTCCTCCAACTTCCTGATTTTAATAAGACTTTTGAGCTTGAATGTGATGCTAGTGG +AATTGGAT TGGGTGGTGTTTTGTTACAAGAAGGCAAACCTGTAGCATATTTTAGTGAAA +AATTGAGTGGGTCTGTTCTAA ATTATTCTACTTATGATAAGGAATTATATGCTCTTGTG +CGAACATTAGAAACATGGCAGCATTATTTGTGGC CCAAAGAGTTTGTTATTCATTCTGA +TCATGAATCTTTGAAACATATTCGTAGTCAAGGAAAACTGAACCGTA GACATGCTAAGT +GGGTTGAATTTATCGAATCGTTTCCTTATGTTATTAAGCACAAGAAAGGAAAAGAGAATA + TCATTGCTGACGCTTTGTCTAGGAGATATACTTTGCTGAATCAACTTGACTACAAAATC +TTTGGATTAGAGA CGATTAAAGACCAATATGTTCATGATGCTCATTTTAAAGATGTGTT +GCTGCATTGTAAAGATGGGAAAGGAT GGAACAAATATATCGTTAGTGATGGGTTTGTGT +TTAGAGCTAACAAGCTATGCATTCCAGCTAGCTCCGTTC GTTTGTTGTTGTTACAGGAA +GCACATGGAGGTGGCTTAATGGGACATTTTGGAGCAAAGAAAACGGAGGACA TACTTGC +TGGTCATTTCTTTTGGCCCCAAGATGAAAAGAGATGTGGTGAGATTGGTTGCTCGTTGCA +CGACA TGTCAAAAGGCGAAGTCACGGTTAAATCCACATGGTTTGTATTTGCCTCTACCT +GTTCCTAGTGCTCCTTGG GAAGATATTTCTATGGATTTTGTGCTGGGATTGCCTAGGAC +TAGGAAGGGACGTGATAGTGTGTTTGTGGTT GTTGATAGATTTTCTAAGATGGCACATT +TCATACCATGTCATAAAACTGACGATGCTACTCATATTGCTGAT TTGTTCTTTCGTGAA +ATTGTTCGCTTGCATGGTGTGCCCAACACAATCGTTTCTGATCGTGATGCTAAATTT CT +TAGTCATTTTTGGAGGACTTTGTGGGCAAAATTGGGGACTAAGCTTTTATTTTCTACTAC +ATGTCATCCT CAAACTGATGGTCAAACTGAAGTTGTGAATAGAACTTTGTCTACTATGT +TAAGGGCAGTTCTAAAGAAGAAT ATTAAGATGTGGGAGGACTGTTTGCCTCATGTTGAA +TTTGCTTATAATCGACCATTGCATTCTACTACAAAG ATGTGCCCATTTCAGATTGTATA +TGGTTTGTTGCCTCGTGCTCCTATTGATTTAATGCCTTTGCCATCTTCT GAAAAACTAA +ATTTTGATGCTACTAGGCGTGCTGAATTGATGTTAAAACTGCATGAAACTACTAAAGAAA +AC ATAGAGCGTATGAATGCTAGATATAAGTTTGCTAGTGATAAAGGTAGAAAGGAAATA +AATTTTGAACCTGGA GATTTAGTTTGGTTGCATTTTAGAAAGGAAAGGTTTCCTGAATT +ACGAAAATCTAAATTGTTGCCTCGAGCC GATGGACCGTTTAAAGTGCTAGAGAAAATTA +ACGACAATGCATATAGGCTAGATCTGCCTGCAGACTTTGGG GTTAGCCCCACATTTAAC +ATTGCAGATTTAAAGCCCTACTTGGGAGAGGAAGTTGAGCTTGAGTCGAGGACG ACTCA +AATGCAAGAAGGGGAGAATGATGAAGACGTCCACACTACTGATACATCTATGCCAATACA +AGTACCAATTTCTGGTCCCATTACTCGCGCTCGTGCTCGTCAACTCAACCATCAGGTGAT +TACACTCTTGAGTTCATGTCCATCTTATTTAGACCATGGAGACCCGTGCACTCTTGTTTT +GCTTAGGAACCAGGGAGAAGACCGAAAGGGAAAAGGATTTGAACATGCTGGATTCGGACT 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+ATTATGCTCAGGTGTTTGGGAGGTGAACCATCTTGGAC TGGAGAAGGCAACAAGGCAAT +AAAGGCTGCTGCACCCGAGAGGATTTCGTAACAGCACCAAGTACAAGTTTA AATGGGGC +ATATCTTCCAACTTCCAAGGCCGTTTAATGCAAATAAATACTTGTTGGAAAGCTCCCTTC +GTCT ACTTGCTGGTGGATCAAGAATTAATGGGAGACTACACCCGAGGCGTCCAGAAACT +GCCGAGGGAACTTCATG ACTCCACCAGAATTCCTTCTTCCTATTTCTCTATTTAAGCAA +CTAGCAGCCACCAAAGAACTTGGGTTTTGT TTGATGTAAGTTTAGCCTTTGCTACTTCC +TTGTAAACGCGTGTGTCGGCTAGACCACCCGAATACTTGAAAC GGGACCCCAACTTTAT +CAGATCCGTGCGTGTTTGCTTGTTATCTTGTTCTTGCTTGTTCTCGATTGCTTGCA GGT +TCAAGGCTGTTCTTGGCACGGCAAGAGCAGCAACAACAGGAGCCGGTGTAACTATCGCTA +AGGCGCAGC ACCCTTGTGGTTGTTGTAGTCGGATAGCACAACGTTGACCTCCACCCCAA +ATCGTAGTTATCAGGAGACGGT GTACCTGTCGCTAAAGGCGCCACACCATCTTGGTTGT +GGTAGTCGGGCAGCCAACGTCGTTCTCCAACAAGT TTTCCACCTCCATCATCTCTCATC +GAAAGATCGGGCACCCTTCTACCCGTTGGGTTCATCAAGTGGTATCAA ATTTCAGGTTG +CTCGGTGAGAGATCTCCATCTTCCTTATTTTATTTACCTACAGTCCACTTTTGCCAAAGA +T ATATTTAGAGCAGAAAATCACCTAAAAACATTTTGAGCCTTTGCTTTACTACTTAGTT +TTCGACTTGTTGAA TTCACGGTTGCTGCATTTGTGTCGAGTTGCTGGTCCAAAGTTTCT 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