Remove hardcoded specifics

[jonatanmindroad]

Hardcoded logic for specific values should be replaced (where possible) with general code working using specific data from yaml-files.

Examples:

• dwca_generator/dwca_data_shark.py

[mikaelhedblom]

In dwca_format_standard.py:

• # IFCB sample vol unit fix litres to millilitres

• # Seal Pathology area fix using obis.org/maptool moving position from county capital to position in water and with individual uncertainty radius m (dwca_seal_pathology.yaml, SealPathology)

• #Greyseal fix fix using obis.org/maptool moving position from county capital to position in water and with individual uncertainty radius m (dwca_greyseal_nat.yaml, GreySeal)

• # Phytoplankton fix (dwca_phytoplankton_nat.yaml, Phytoplankton)

• # Measurement identifiers. NERC vocabular. # nerc codes found at https://vocab.nerc.ac.uk/collection/P01/current/ (generellt, dessa 50 ish fixar gäller parameter-namn i samtliga datapaket)

• #nerc codes found at https://vocab.nerc.ac.uk/collection/P06/current/ (generellt, samma som ovan punkt. dessa fixar gäller dock unit-namn.)

• #Phytoplankton (dessa följer på ovan punkt men generellt för dwca_phytoplankton_nat.yaml, Phytoplankton)

• #IFCB (dessa följer på ovan punkt men generellt för dwca_phytoplankton_ifcb.yaml, IFCB)

In dwca_data_shark.py:

• # For empty observations use "absent" in occurrenceStatus. (dwca_ringedseal_nat.yaml, dwca_picoplankton_nat.yaml, dwca_harbour_porpoise_nat.yaml, RingedSeal, Picoplankton, HarbourPorpoise)
• # Use coordinate_uncertainty_m for some data. # County AB or A or B. and so on..... (detta är första funktionaliteten för att fixa positioner för sälar. punkten under är vidarebyggen för att förbättra delar av detta, i dwca_format_standard. men den här gäller alla säl, dwca_greyseal_nat.yaml, dwca_harbourseal_nat.yaml, dwca_ringedseal_nat.yaml, dwca_seal_pathology.yaml, GreySeal, HarbourSeal, RingedSeal, SealPathology)

In dwca_format_standard.py:

• # Seal Pathology area fix using obis.org/maptool moving position from county capital to position in water and with individual uncertainty radius m (skriver över vissa värden definierade i ovan punkt. dwca_seal_pathology.yaml, dwca_greyseal_nat.yaml, SealPathology, GreySeal)