As listas de espécies já geradas podem ser baixadas aqui: Você pode ler ou baioxar listas individuais aqui:
- analyses/ - scripts para tratamento dos dados
- []
- data - dados usados pela ferramenta, informações sobre bases de dados e localidades
- data-input - dados brutos baixados dos Herbários Virtuais
- data-tmp - arquivos intermediários criados por esta ferramenta
- plots - figuras
- R - funções usadas pelos scripts
- results - resultados, incluindo as listas de espécies
- allfields - listas de espécies contendo todos os campos, em formato .csv
- checklists - listas de espécies no formato do Catálogo de Plantas das UCs do Brasil
- total - todos os registros encontrados em cada UC, em formato .rda
- total-treated - todos os registros encontrados em cada UC, em formato .csv
- Antes de começar, é preciso baixar os dados atualizados das bases de dados:
- GBIF - arquivos .zip
- Reflora - arquivos .csv
- splink (obs.: para baixar dados em grandes quantidades, será necessário criar uma conta) - arquivos .txt
- JABOT - arquivos .csv
Os dados devem ser salvos nas respectivas pastas dentro de data-input/. No caso de mais de um arquivo serem salvos na mesma pasta, o script combinará os dados dos arquivos diferentes antes de iniciar o tratamento dos dados. No caso dos dados Reflora, por favor abra os arquivos e salve como csv na mesma pasta antes de prosseguir.