Este programa lê um conjunto de tabelas (CSV ou DBF) com dados de óbitos codificados de acordo com o Sistema de Informação sobre Mortalidade (SIM) e, a partir das informações disponíveis nas colunas já existentes, cria um único arquivo contendo todos os dados após o acréscimo de algumas colunas. Para instruções de instalação e uso, veja o arquivo README_INSTALL.md.
Para informações sobre o projeto do qual este programa faz parte, consulte o site do projeto ou o repositório de índice.
O programa salva um único arquivo no formato CSV (comma-separated values), que pode ser aberto por diversos programas que tratam de dados tabulados, tais como R, Microsoft Excel, LibreOffice, SAS, Stata e MiniTab.
Importante:
- Se algum dos arquivos de entrada contiver mais de uma coluna com o mesmo nome, apenas uma será mantida. Isto é uma consequência do funcionamento dos parsers.
- Se algum dos arquivos de entrada possuir alguma coluna com o mesmo nome de uma das colunas a serem inseridas por este programa, a coluna original será substituída.
Seguem as colunas que este programa insere. Note que não são inseridas colunas que dependem da existência de colunas que não estão presentes nos arquivos de entrada.
-
DIA,MESeANO: representam o dia, o mês e o ano do falecimento, a partir da colunaDTOBITO. -
SEMANAEPIeANOEPI: representam o número da semana epidemiológica à qual pertence o dia de falecimento obtido na colunaDTOBITO, e o ano correspondente (que pode não ser igual ao valor deANO). -
IDADEGERAL,IDADECAT1eIDADECAT2: representam, respectivamente, a idade em anos e as categorias descritas na tabela abaixo.
Intervalo de IDADEGERAL |
IDADECAT1 |
IDADECAT2 |
|---|---|---|
| menos de 1 ano | 1 | 1 |
| 1 a 4 anos | 2 | |
| 5 a 9 anos | 3 | 2 |
| 10 a 14 anos | 4 | |
| 15 a 19 anos | 5 | |
| 20 a 24 anos | 6 | 3 |
| 25 a 29 anos | 7 | |
| 30 a 34 anos | 8 | |
| 35 a 39 anos | 9 | |
| 40 a 44 anos | 10 | 4 |
| 45 a 49 anos | 11 | |
| 50 a 54 anos | 12 | |
| 55 a 59 anos | 13 | |
| 60 a 64 anos | 14 | 5 |
| 65 a 69 anos | 15 | |
| 70 a 74 anos | 16 | 6 |
| 75 a 79 anos | 17 | |
| 80 a 84 anos | 18 | 7 |
| 85 a 89 anos | 19 | |
| 90 anos ou mais | 20 | 8 |
AREARENDA: representa a renda do bairro de residência obtido a partir da colunaCODBAIRES, de acordo com os valores abaixo.
Renda do bairro de código CODBAIRES |
AREARENDA |
|---|---|
| Alta | 1 |
| Intermediária | 2 |
| Baixa | 3 |
-
GARBAGECODE: indica o nível da Causa Global de Morbidade (GBD) correspondente à causa básica obtida na colunaCAUSABASquando é um garbage code, entre 1 e 4, ou 0 em caso contrário (segundo a Appendix Table 3 do Supplementary appendix 1 que acompanha o artigo Global, regional, and national age-sex specific mortality for 264 causes of death, 1980–2016: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2016). -
CAPCID: indica o número do capítulo da CID-10 que contém a causa básica obtida na colunaCAUSABAS, ou "**" caso o valor da coluna seja inválido. -
COVID: representa a possibilidade de a causa obtida na colunaCAUSABASindicar um óbito causado pela COVID-19, conforme tabela abaixo.
CAUSABAS |
COVID |
|
|---|---|---|
| U04 | Suspeita | 2 |
| B34.2 | Sim | 1 |
| Ausente | Sem informação | 0 |
| Inválida | ||
| Outra | Não |
-
CIDBR: indica o código da CID-BR-9 correspondente à causa básica da colunaCAUSABAS. -
DCOR,OUTCOR,AVC,GRIPE,PNEUMONIA,DPOCASMA,GPP,PERI,ACTRANS,QUEDAFOGINT,SUIC,HOMIC,EXTIND,INTLEGeOUTEXT: indicam o tipo da causa obtida na colunaCAUSABAS, de acordo com a tabela abaixo. Essas colunas têm valor 0 se a causa não estiver no intervalo. Quando a causa está no intervalo, o valor dessas colunas é 1, com exceção das colunasGPPePERI, que variam de 1 a 5 conforme o código CID-BR varia de 88 a 92 e de 93 a 97, respectivamente.
| CID-BR | Coluna | Nome (segundo CID-BR-9) |
|---|---|---|
| 68 | DCOR |
Doenças isquêmicas do coração |
| 69 | OUTCOR |
Outras doenças cardíacas |
| 70 | AVC |
Doenças cerebrovasculares |
| 73 | GRIPE |
Influenza (gripe) |
| 74 e 75 | PNEUMONIA |
Pneumonia; Outras infecções agudas das vias aéreas inferiores |
| 76 | DPOCASMA |
Doenças crônicas das vias aéreas inferiores [incl. DPOC e asma] |
| 88 a 92 | GPP |
Gravidez, parto e puerpério |
| 93 a 97 | PERI |
Algumas afecções originadas no período perinatal |
| 104 | ACTRANS |
Acidentes de transporte |
| 105 até 108 | QUEDAFOGINT |
Quedas; Afogamentos e submersões acidentais; Exposição à fumaça, ao fogo e às chamas; Envenenamento acidental por e exposição a substâncias nocivas |
| 109 | SUIC |
Lesões autoprovocadas voluntariamente |
| 110 | HOMIC |
Agressões |
| 111 | EXTIND |
Eventos (fatos) cuja intenção é indeterminada |
| 112 | INTLEG |
Intervenções legais e operações de guerra |
| 113 | OUTEXT |
Outras causas externas |
Este repositório e os demais repositórios deste grupo fazem parte do projeto Recovida (Reavaliação da Mortalidade por Causas Naturais no Município de São Paulo durante a Pandemia da COVID-19), da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, sob responsabilidade do Prof. Dr. Paulo Andrade Lotufo, e com a atuação da Dra. Ana Carolina de Moraes Fontes Varella como supervisora de dados.
Sob a orientação de Paulo Lotufo e a supervisão de Ana Varella, o desenvolvimento está sendo feito por:
- Débora Lina Nascimento Ciriaco Pereira (bolsista de dez/2020 a set/2021);
- Vinícius Bitencourt Matos (bolsista de dez/2020 a set/2021).
Agradecemos à iniciativa Todos pela Saúde, da Fundação Itaú para Educação e Cultura, pelo financiamento deste projeto.
Agradecemos também à Secretaria Municipal da Saúde da Prefeitura da Cidade de São Paulo pela parceria durante a execução do projeto.