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BIOP01-63: MoFlow run-to-run 재현성 결과 draft_v2/ko 반입 - #19

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Aug 11, 2026
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BIOP01-63: MoFlow run-to-run 재현성 결과 draft_v2/ko 반입#19
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@JamieLyu

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무엇을 했는가

BIOP01-63(PR #17, results/moflow_runtorun_null.md, 판정 MOFLOW-REPRODUCIBLE)이 병합된 뒤 draft에는 아직 반영되지 않았던 부분을 채웠다. kkkim님이 PR #17 코멘트(2026-08-06)에서 "이제 draft 반영으로 넘어가셔도 됩니다"라고 확인한 작업이다.

어디를 고쳤는가

draft_v2.md / draft_v2_ko.md 각 2곳(영/한 동시, 표현만 다르고 수치·근거는 동일):

  1. Results — 세포×유전자 velocity 행렬 절: "MoFlow는 확률적 심층 모형이고 동일 설정 재실행 안정성이 확립된 적이 없다(never established) … 불일치와 불안정이 분리되지 않는다" 캐비엇을, 실제로 확립된 재실행 천장(+0.9999 [+0.9999,
    +0.9999], run1 vs run2 +1.0000)으로 교체. 근접-0 세 쌍(MV×MoFlow −0.0118, MoFlow×CRAK +0.0019, MoFlow×VAE +0.0019)의 절댓값 최댓값(0.0118)이 이 천장에 훨씬 못 미치므로, 세 쌍은 MoFlow 자신의 불안정이 아니라 방법 간 진짜 근접-0 일치로 읽을
    수 있다는 결론으로 정리. 같은 천장이 MoFlow의 원본 대 셔플 값(+0.113)도 재실행 잡음 수준 밖에 있음을 뒷받침한다는 문장도 추가.
  2. Methods — Cell-level velocity-matrix audit 절: "no same-cell same-configuration rerun null was available for either arm"(이제 부정확)을, MultiVelo(velocity_matrix_runtorun_null.md)·MoFlow(moflow_runtorun_null.md) 각각에 대해
    별도로 재실행 귀무가 확보됐다는 서술로 교체.

무엇을 안 건드렸는가

  • 인과 해석(크로마틴이 매트릭스를 인과적으로 움직인다는 주장)은 여전히 MultiVelo 한정으로 유지했다. MoFlow의 재실행 결과는 "근접-0 쌍이 arm 불안정으로 설명되지 않는다"는 별개의 좁은 판정(MOFLOW-REPRODUCIBLE, moflow_runtorun_null.md §4)만
    뒷받침하며, MoFlow 자체에 새 인과 주장을 추가하지 않았다 — claim-defensibility 게이트 대상 밖으로 좁게 잡았다.
  • results/velocity_matrix_audit.md 등 봉인 감사 문서는 읽기만 하고 건드리지 않았다(moflow_runtorun_null.md 자체 규율).
  • 그 외 본문·수치는 무변경.

kkkim님 리뷰 부탁드립니다.

results/moflow_runtorun_null.md(PR #17, 판정 MOFLOW-REPRODUCIBLE)를
Results·Methods 본문에 반영. 근접-0 세 쌍(MV×MoFlow, MoFlow×CRAK,
MoFlow×VAE)이 MoFlow 자체 불안정이 아니라 방법 간 진짜 근접-0 일치임을
재실행 천장(+0.9999, run1 vs run2 +1.0000)으로 뒷받침. "never
established / uninterpretable / not separable" 캐비엇을 결과로 교체.
@kakyungkim
kakyungkim merged commit 6270117 into kkkim-pipeline Aug 11, 2026
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