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micagonzdark/RedesHospitales

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RedesHospitales

Proyecto de análisis de redes de traslados de pacientes en la Red Sudeste (Conurbano Sur, Buenos Aires). Cubre 14 hospitales en los municipios de Quilmes, Almirante Brown, Florencio Varela y Berazategui, con datos de marzo 2020 a diciembre 2022.

Estructura del repositorio

RedesHospitales/
├── JAIIO_notebooks/          # Notebooks de producción (para publicación)
│   └── results/outputs/      # Outputs generados (mapas, tablas)
│         └── /red/
│         └── /geo/           
│   ├── 01_redes_basico.ipynb
│   ├── 02_mapas.ipynb
│   ├── 03_ranking_trayectorias.ipynb
│   └── 04_trayectorias_causas.ipynb
├── definitions_notebooks/    # Definición de reglas clínicas y pipelines (ETL)
│   ├── 01_limpieza_episodios.ipynb
│   ├── 02.TRAYECTORIAS.ipynb
│   ├── 03.TRASLADOS.ipynb
│   ├── 04.COMPARACION.ipynb
│   └── criterios_y_decisiones.md
├── data/                     # Datos (no incluidos en el repo, ver abajo)
├── docs/                     # Documentación y notas del proyecto
├── src/                      # Módulos Python reutilizables
│   ├── config.py
│   ├── io.py
│   ├── funciones_complejas.py
│   └── visualizacion.py
├── scripts/                  # Scripts auxiliares (viejos)
├── results/                  # Resultados y análisis
└── requirements.txt

Los notebooks de exploración anteriores se encuentran en OLD_notebooks/exploracion_vieja/ (solo local, ignorados por git).

Notebooks de producción (JAIIO)

Ejecutar en orden desde JAIIO_notebooks/:

# Notebook Descripción
01 01_redes_basico.ipynb Construcción y análisis de la red de traslados (grafo, métricas, visualización)
02 02_mapas.ipynb Mapas geográficos interactivos de la red hospitalaria
03 03_ranking_trayectorias.ipynb Ranking y análisis de trayectorias de pacientes
04 04_trayectorias_causas.ipynb Análisis de trayectorias por causa de internación

Instalación

pip install -r requirements.txt

Datos necesarios (no incluidos en el repo)

Colocar en data/:

  • pacientes.xlsx — base de episodios de internación
  • hospitales_coordenadas.csv — coordenadas de los hospitales
  • shapefiles/departamento/departamentoPolygon.shp — shapefile de departamentos

Módulos principales (src/)

  • config.py: Rutas y parámetros globales del proyecto.
  • io.py (init_notebook): Inicializa el entorno de análisis (carga datos, coordenadas y shapefiles).
  • funciones_complejas.py: Construcción y análisis de grafos/redes.
  • visualizacion.py: Funciones de graficación y mapas.

About

Graph and geospatial analysis of patient trajectories across 14 public hospitals in Buenos Aires. Research conducted at UBA to understand and optimize public health networks.

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