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toxin98/qPCR-fast-process

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使用说明

快速处理384孔qPCR数据,纯excel完成。

试用范围

QuantStudio™ 6 Flex Real-Time PCR System
没用过其他的

可编辑范围

仅仅编辑Sheet1的列A:D,J1:L4区域完成对孔板的定义。

建议每次都先另存为xlsx, 请勿擅自插入行或列, 防止破坏公式。

方法

ΔΔCt法

  1. 长数据转成矩阵
  2. ΔCt = Ct目的-Ct内参
  3. 单个样品目的基因的相对模板量R = 2^(-ΔCt)
  4. 按对照组标准化,即2^(-ΔΔCt)

操作

  1. 打开仪器导出的xls文件, 从工作表Results里分别复制Well Position, Sample Name, Target Name, CT列的内容粘贴到qPCR-fast-process.xlsx的工作表Sheet1的A:D列

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  2. 接着在右侧J1:L4区域完成对板子的定义。
    以示例数据为例, 对384板来说, 基因散落在不同的列中, 那么对应的就是这里的genes-in-cols, 只填写L2:L4区域就行。
    示例数据的housekeeping gene是Rps18, 在列4。
    示例数据的control group, 从行A开始到行D。
    填写完成以后直接转到工作表genes-in-cols, 滚轮到最下方查看结果。

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兼容性

Excel 2013及以上版本, 未在WPS中进行验证

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